ТОР 5 статей: Методические подходы к анализу финансового состояния предприятия Проблема периодизации русской литературы ХХ века. Краткая характеристика второй половины ХХ века Характеристика шлифовальных кругов и ее маркировка Служебные части речи. Предлог. Союз. Частицы КАТЕГОРИИ:
|
IV. Методы анализа амплифицированных фрагментов.Анализ амплифицированных фрагментов позволяет: 1) идентифицировать микроорганизмы; 2) выявлять подтипы микроорганизмов одного вида; 3) выявлять мутации в ДНК. Внутривидовое типирование особенно важно при проведении эпидемиологических исследований. По сравнению с традиционными фенотипическими методами, генотипирование на основе ПЦР отличается универсальностью, более глубоким уровнем дифференциации, возможностью использования количественных методов для оценки идентичности штаммов. 1. Полиморфизм длины рестрикционных фрагментов (ПЦР-ПДРФ, англ. - RFLP). Используя ПЦР, амплифицируют определенный генетический локус. Далее продукт амплификации расщепляют рестрикционными эндонуклеазами. При этом образуются фрагменты различного размера, которые при проведении электрофореза образуют профили, различные у разных видов (вариантов) микроорганизмов. 2. Полиморфизм длины амплифицированных фрагментов (ПДАФ, англ. – AFLP). В отличие от предыдущего метода рестрикцию проводят до ПЦР. ДНК тест-микроорганизма с использованием рестриктазы нарезают на фрагменты, затем проводят ПЦР.В результате образуются фрагменты различного размера, которые при проведении электрофореза образуют профили, различные у разных видов (вариантов) микроорганизмов. 3. Полиморфизм конформации однонитевой ДНК (ПЦР-SSCP). Используют для выявления точечных мутаций в ДНК. Проводят ассиметричную ПЦР, что сопровождается накоплением однонитевых молекул ДНК, которые разделяют при помощи электрофореза в денатурирующем геле, позволяющем разделять фрагменты, отличающиеся друг от друга одним нуклеотидом.
Не нашли, что искали? Воспользуйтесь поиском:
|