Имитационная модель развития апикальной меристемы Арабидопсиса на эмбриональной и вегетативной стадиях развития в сетях Петри.

Миронова В.В., Ожогин М., Николаев С.В., Омельянчук Н.А.

Введение

В отличие от животных, формирующих все основные органы в эмбриональный период, растения могут образовывать органы в течение всей жизни. Благодаря существованию апикальных меристем побега (далее АМП), содержащих стволовой запас растения, происходит постэмбриональное развитие и рост всей надземной части растения. Наибольшее количество работ по изучению АМП было проведено на модельном растении Arabidopsis thaliana. Эта информация является достаточно разнородной, так как наряду с описанием процессов онтогенеза и паттернов экспрессии генов в диком типе содержит описание фенотипических аномалий и изменений экспрессии генов в мутантах и трансгенных растениях. Систематизация и анализ таких данных помогут выявить основные процессы, происходящие в развивающихся тканях и органах, описать их характеристики, последовательность и ключевые регуляторы. В качестве источника данных использовалась база данных AGNS DB (Arabidopsis GeneNet Supplementary Data Base), а именно два ее раздела: AGNS_PD и AGNS_ED.

Нами была построена имитационная модель развития АМП Arabidopsis thaliana, которая объединяет в себе информацию об онтологии развития АМП на эмбриональной и вегетативной стадиях, сопоставленную с нарушениями развития и экспрессии генов в мутантах. Данная модель позволяет выявлять основные этапы в развитии АМП, конструировать in silico фенотипы двойных и тройных мутантов, просматривать развитие аномалии фенотипа на различных стадиях онтогенеза и вклад определенных генов в формирование признаков.

Не нашли, что искали? Воспользуйтесь поиском: