Транспозоны млекопитающих

У млекопитающих в составе генома обнаружено несколько классов умеренно повторенных последовательностей: SINE (short interspersed nuclear elements) и LINE (long interspersed nuclear elements). Элементы SINE — это фрагменты длиной 100—300 пн, чередующиеся с уникальными последовательностями от 1000 до 2000 пн. Элементы LINE имеют длину более 5 тпн, они чередуются с уникальными последовательностями до 35 тпн длиной.

В геноме человека элементы SINE широко представлены семейством повторов Alu. Члены этого семейства имеют длину 300 пн и повторены в геноме от 300 000 до 500 000 раз. Около 3% геномачеловека приходится на долю этих повторов. Наименование Alu этот элемент получил, поскольку содержит сайт узнавания рестриктазой AluI. Каждая Alu -последовательность фланкирована прямыми повторами длиной от 7 до 20 пн. По этой причине полагают, что Alu- повторы являются мобильными элементами, скорее всего ретротранспозонами.

Одно из семейств элементов LINE – это LINE-1 (или L1-элемент). Полагают, что в геноме человека присутствует 50-100 тыс. копий L1, т. е. он представляет около 5% генома. Максимальная длина этих элементов составляет 6500 пн, хотя именно таких элементов в геноме не более 3500. Остальные же копии по аналогии с Ds элементами кукурузы имеют внутренние делеции различной длины. Полноразмерные элементы кодируют обратную транскриптазу.

Не нашли, что искали? Воспользуйтесь поиском: